尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染所形成的性传播疾病，主要是在外生殖器和肛门周围出现疣状的皮肤新生物，因此，肛门尖锐湿疣治疗上可能需要数次及数月才能痊愈，具体要看治疗的方法和医生的经验而定。
肛门部位长了尖锐湿疣治疗次数可能会比外阴要多一些，因为这个部位长期处于温暖、潮湿的条件下，引起尖锐湿疣的HPV病毒喜好这样的环境，在温暖潮湿的环境下更容易复制、繁殖，促进疾病反复发作。
医院常见的治疗方法一般有激光、冷冻、电灼、光动力或手术切除等，还有一些化学药物，以涂剂、膏剂、擦剂等为主。这些治疗方法主要针对局部病变疣体，所以在祛疣上效果比较显著。
但是常规治疗只能清除肉眼可见的疣体，大量肉眼不可见的亚临床感染和潜伏感染未能同步彻底清除，成为尖锐湿疣反复发作的关键因素和根源。治疗尖锐湿疣的目的是彻底清除HPV病毒，只有把病毒清除干净了，这个疾病才不会复发。
初发患者如果通过治标不治本的方式，例如激光、电灼、冷冻，或是外用化学药物进行腐蚀，能较快地把疣体组织去除，之后肉眼不可见的病毒仍然存在，因此复发率很高。一般都会多次发作，少则2-3次，多则5-6次，最后不得不选择其他治疗方法。
温馨提醒：对于尖锐湿疣的治疗，并不是说非得出现复发才能康复，只要方法得当，在疣体去除后把表皮细胞棘层、基底层的HPV病毒清除干净，尖锐湿疣也就能痊愈，不会出现多次复发的情况。
相比之下，通过中医方式用药治疗，循序渐进地“去疣清毒”才是治愈的根本方法。HPV病毒只存在于表皮细胞的棘层、基底层，2011101665723号国家发明专利配方根据个人病情制定方案，将病变疣体和HPV病毒一并清除，待治疗结束停药观察一年即痊愈。