阴茎尖锐湿疣是一种极易复发的疾病，如何降低其复发率，措施有以下几方面：
(1)提高身体免疫力、加强锻炼、注意休息，适当了解一些医学知识，正确对待疾病，保持心情舒畅。
(2)性伴侣同时诊疗是保证治愈的前提。
(3)激光等手术方法，只能对疣体进行治疗。而亚临床感染(已经感染HPV病毒、但还没有长出疣体)部位，由于看不到疣体，无法采取有效的治疗措施。另外，激光等手术方法受医生操作水平的影响较大，尤其是小的疣体，深浅更不容易把握，这些都是造成复发率高的重要原因。因此，可在生殖器部位涂3%～5%醋酸检查是否有亚临床感染或进一步活检，尽快早期治疗。
(4)引起阴茎尖锐湿疣的病毒易在皮肤表面播散，不恰当的治疗往往使病毒播散更快，引起复发，因此要到专科医院接受正规治疗。